《攻壳机动队2015剧场版》讲述公元2029年3月，日本总理大臣暗杀事件出现。在闻所未闻的恐怖袭击中，草薙素子曾从属的501机关的上司库露兹也成为了被害者。战后最凶恶的事件爆发，素子等人立刻开始搜査。随着调查深入，素子开始追查犯人头目，为此，她召集曾合作过的能人异士。这些人大多从未有过团队合作的经验，因此最初并不顺利，但即使如此，大家也一点点揭示出事件的真相。在大使馆中发生的人质事件、总理大臣暗杀事件的背后，他们发现了一种特殊的电脑病毒fire starter，随后大家发现，这件事与素子诞生的秘密有关当理解恐怖事件的全貌之时，素子等怪人集团也陷入危机，渐渐走入绝境，此时素子向大家下令：听从自己的GHOST。这便是后来以STAND ALONE TEAM闻名的攻壳机动队诞生的故事。
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